1918年，香港新界傳道會租賃大新街36號，開辦端儀女校，是島上第一間教會團體開辦的女校。1935年，盧恩信女士創辦長洲女校，校舍在新興後街，採用複式形式教授。香港淪陷期間，兩所女校被迫停止營運。重光以後，學額需求甚殷，長洲女校改為男女校，盧女士留任校長。1957年校舍不敷應用，於今山頂道興建新校舍。1978年，中華基督教會長洲堂受盧女士之託，接辦長洲女校。1980年，女校正式易名長洲堂錦江小學，校名以中國基督教會史上首位殉教的基督徒車錦江先生命名。2001年，校舍再擴建一幢五層高新翼，兩年後竣工，同年10月20日正名為中華基督教會長洲堂錦江小學。

 中華基督教會長洲堂錦江小學校歌